Desde el año 1974, fecha  la que se publicó el primer trabajo de investigación sobre la Cueva Pintada, se han sucedido una serie de trabajos de diversas materias que a lo largo de estos más de 40 años , han tenido como objetivo principal,  profundizar en el conocimiento de este singular enclave patrimonial. La arqueología, la conservación, la museología, y más recientemente la difusión, el público y los sistemas de aprendizaje, son algunos de los temas recogido en estas ya más de 50 referencias bibliográficas que se han publicado en diferentes revistas especializadas. El ritmo en las publicaciones se acrecentó a partir del año 2006 en el que se inauguró el museo. A continuación, y ordenado por la fecha de la publicación, se pueden consultar dichas referencias.