Desde el año 1974, fecha en la que se publicó el primer trabajo de investigación sobre la Cueva Pintada, se han sucedido una serie de trabajos de diversas materias que, a lo largo de estos más de 40 años, han tenido como objetivo principal profundizar en el conocimiento de este singular enclave patrimonial. La arqueología, la conservación, la museología, y más recientemente la difusión, el público y los sistemas de aprendizaje, son algunos de los temas recogidos en estas ya más de 80 referencias bibliográficas que se han publicado en diferentes revistas especializadas. El ritmo en las publicaciones se acrecentó a partir del año 2006, fecha en el que se inauguró el museo.
A continuación, se pueden consultar dichas referencias, tanto en un documento con todas ellas, como en los siguientes apartados, los cuales se encuentran ordenados por la fecha de la publicación.